Лямбда штамм что это
В ритме штамма: что известно о «Лямбда»-варианте коронавируса
Высокопатогенный «Лямбда»-штамм коронавируса уже выявили в Аргентине, Чили, Австралии, Бразилии, Эквадоре, Германии, Испании, Великобритании и США. Впервые этот вариант SARS-CoV-2 обнаружили перуанские ученые в августе 2020 года. С тех пор он значительно распространился по Южной Америке. Ученые из этого региона пишут, что критическая ситуация в системе здравоохранения и рост смертности связаны с растущей распространенностью именно варианта «Лямбда». У этого штамма есть мутации в шипе коронавируса, которые обычно связывают с более эффективным проникновением в клетки и способностью «уходить» от антител.
Латиноамериканский мотив
В Россию недавно проникли штаммы коронавируса «Дельта» и «Дельта плюс», которые специалисты оценили как более патогенные: для заражения COVID-19 нужно меньшее количество вирусных частиц. Такие варианты могли появиться только в месте, где много зараженных, то есть вирус способен пройти эволюционный отбор на большом количестве болеющих людей. Такая ситуация наблюдается в Индии, которая сейчас на втором месте в мире по числу инфицированных.
Есть еще один огромный резервуар, где вирус может эффективно эволюционировать, — Бразилия (на третьем месте по количеству зараженных) и другие страны Латинской Америки: Аргентина (8-е место), Колумбия (10-е), Перу (18-е), Чили (22-е). В этом регионе возник штамм «Лямбда». ВОЗ присвоила такое название этому варианту коронавируса 15 июня. Организация обозначила этот штамм как Variants of Interest (VOI) — вызывающий интерес. Вскоре ВОЗ может переквалифицировать его в вызывающий беспокойство (Variant of Concern, VOC), считают специалисты диагностической лаборатории SARS-CoV-2 клинической больницы Порту-Алегри (Риу-Гранди-ду-Сул, Бразилия). Об этом ученые написали в научной статье «Первое выявление варианта SARS-CoV-2 Lambda (C.37) в южной части Бразилии».
Сейчас этот штамм обнаружен уже в 26 странах мира, в том числе в Аргентине, Чили, Австралии, Бразилии, Эквадоре, Германии, Испании, Великобритании и США. Это подтверждается и в статье перуанских ученых. Аргентинские ученые обращают внимание на абсолютную уникальность «Лямбды»: «Сочетание мутаций, характерных для вариантов «Бета» (южноафриканский штамм) и «Дельта» (индийский штамм), не обнаружено».
Бразильские генетики обратили внимание на новую мутацию S-белка в этом варианте: Δ246-252. Ее опасность пока не оценена. Перуанские ученые также выражают беспокойство по поводу этой мутации. Они написали, что другие мутации в белке-шипе коронавируса связаны с распространенными инфекциями у пациентов с подавленным иммунитетом.
— Пока не представляется возможным сказать, к каким именно изменениям приведет эта мутация, — сказал «Известиям» руководитель лаборатории геномной инженерии МФТИ Павел Волчков. — Но любая мутация в RBD-домене (рецептор-связывающий домен, который отвечает за соединение коронавируса с клеткой организма человека. — «Известия») обычно приводит к улучшению возможности проникновения в клетку и ускользания от антител. Но это еще требуется доказать с помощью дополнительных экспериментов.
Вооружен и очень опасен
Бразильские специалисты обратили внимание на способность «Лямбда»-штамма к более быстрому распространению и пониженной чувствительности к нейтрализации антителами. Это может значительно повлиять на эффективность стратегий борьбы с пандемией COVID-19, написали они.
Аргентинские специалисты описали ситуацию, когда у них на глазах андский вариант (как они называют «Лямбда»-коронавирус) начал побеждать британский.
«На данный момент из в общей сложности 2238 образцов, проанализированных посредством активного наблюдения с помощью секвенирования Spike или всего генома, наиболее обнаруженными вариантами были линия C.37 (андский вариант)», — сообщили ученые.
У штамма «Лямбда» множество мутаций, сказал «Известиям» профессор кафедры геномики и биоинформатики СФУ, профессор Геттингенского университета Константин Крутовский.
— Для нового варианта «Лямбда» характерна делеция в гене ORF1a — Δ3675-3677, приводящая к выпадению трех аминокислот. Этот ген кодирует несколько важных для вируса белков. Эта делеция присутствует также в «Альфа» (британский вариант), «Дельта» (южно-африканский) и «Гамма» (другой бразильский) штаммах с повышенной инфекционностью и классифицируемых ВОЗ как варианты, вызывающие озабоченность.
По словам Константина Крутовского, у штамма «Лямбда» есть новая делеция Δ246-252, приводящая к выпадению семи аминокислот, и множественные значимые мутации в гене шипа. Последние вызывают замены аминокислот в шиповидном белке, ответственном за связывание вируса с рецепторами на поверхности клеток человека. Это в дополнение к 19 другим мутациям, подчеркнул эксперт. Изменения L452Q и F490S находятся в самом важном районе шиповидного белка — рецептор-связывающем домене (RBD). Кроме того, было показано, что мутация F490S связана с пониженной чувствительностью к нейтрализации антител.
Но пока неизвестно, является ли вариант «Лямбда» более инфекционным или патогенным, чем другие штаммы, и способен ли он избегать действия доступных вакцин, отметил Константин Крутовский.
— «Лямбды» можно было бы опасаться, если бы не «Дельта». Их противоборство можно было бы увидеть, если есть страны, где представлен и тот, и другой вариант SARS-CoV-2. Судя по базе, эти штаммы встречаются в некоторых европейских странах. Но, если судить по тому, насколько быстро сейчас распространяется вариант «Дельта», он посильней, — высказал мнение Павел Волчков.
Все-таки лидером по производству новых штаммов остается Индия, хотя страны Южной Америки вполне могут с ней поконкурировать, заключил эксперт.
Японские ученые описали уникальную мутацию штамма коронавируса «лямбда»
Штамм коронавируса Sars-CoV-2 «лямбда» обладает повышенной устойчивостью к иммунитету человека и более заразен. Об этом в препринте исследования сообщили несколько японских молекулярных биологов во главе с доцентом Токийского университета Кеем Сато, передает ресурс bioRxiv.
«Нам удалось показать, что мутации, характерные для этой вариации SARS-CoV-2, защищают вирус от действия антител и делают при этом его более заразным», — говорится в тексте.
Сейчас «лямбда»-штамм активно распространяется в Южной Америке. Откуда он появился – пока неизвестно, но возник он летом 2020 года. До начала распространения индийского штамма «дельта» именно «лямбда»-штамм был самым «популярным» в Перу, на него же приходилось до трети новых заражений в Чили и Аргентине.
В геноме штамма «лямбда», предположительно, присутствует сразу восемь мутаций. Он умеет столь же активно заражать клетки, как и индийский штамм, значительно превосходя британский, южноафриканский и китайский варианты коронавируса.
В ходе опытов исследователи из Японии выяснили, что повышенная заразность «лямбды» связана с изменением характера сцепления коронавируса с клеточным рецептором ACE2.
При этом для нейтрализации штамма требуется примерно в полтора раза больше антител, чем для других вариаций. Это связано с удалением существенной части генома коронавируса, изменением кодирования региона оболочки вируса, куда крепится S-белок, отвечающий за его проникновение в клетку тела.
В тексте указывается, что данная мутация уникальна – ранее она не встречалась ни у одного из описанных штаммов.
Как отмечает агентство ТАСС, препринт научной статьи пока не рецензировали, редакторы научных журналов ее тоже еще не проверяли.
Скоро в России
«Лямбда»-штамм рано или поздно начнет распространяться по России — границы с популярными среди туристов странами открыты, поэтому риски проникновения нового варианта коронавируса возрастают. Об этом «Газете.Ru» ранее сообщала врач-инфекционист Светлана Ищенко.
«Из-за туризма постоянно идет смена территории распространения вируса. Соответственно, он меняет свои патогенные свойства. Покидая территорию, он идет на другую территорию, где население еще не подготовлено», — сказала медик.
С ней согласен врач-инфекционист Евгений Тимаков. По его мнению, для сдерживания распространения нового штамма необходимо вводить ограничения на полеты в страны с высокой заболеваемостью.
«Насколько скоро «лямбда»-штамм придет в Россию, зависит от наших туристических потоков. Все, что есть в мире – будет и в России. Например, мы открыли Турцию – а там рост заболеваемости. Другие туристические страны тоже открыты. Как ситуация будет развиваться, неизвестно. Но, наверное, необходимо пересмотреть ограничительные меры», — сказал медик «Газете.Ru».
Данная мутация пока недостаточно изучена, подчеркнула заведующая лабораторией этиологии и эпидемиологии гриппа Федерального научно-исследовательского Центра эпидемиологии и микробиологии им. Гамалеи Елена Бурцева.
«Прогнозировать что-либо крайне рано: необходимо осуществлять непрерывный мониторинг проявлений вируса. Пока неизвестно, насколько он распространится в России, насколько будет защищать от него вакцина», — пояснила она «Газете.Ru».
Остановить распространение новой мутации поможет вакцинация. Хотя проявления нового штамма пока не изучены, антитела в любом случае помогут быстрее справиться с болезнью. «Сейчас как никогда нужно вакцинироваться и создавать иммунную прослойку. Вакцинация всегда останавливала эпидемии. И если в организме создаются защитные антитела, они на 100% не будут защищать организм, но при встрече с возбудителем болезнь будет протекать легче», — заключила Ищенко.
Новый штамм коронавируса Лямбда напугал повышенной смертностью
Страны Латинской Америки стали новым «котлом» для COVID-19
Похоже, буквы греческого алфавита кончатся быстрее, чем новые выявляемые штаммы коронавируса. Не успели мы опомниться от нашествия Дельты, как в нескольких уголках земного шара уже появилась линия Лямбда. И если в начале пандемии все ждали, что со временем вирус будет становиться более заразным, при этом одновременно снижая свою агрессивность и способность к причинению тяжкого вреда, теперь эксперты оценивают ситуацию более скептически. Так, линия Дельта (индус), по наблюдениям врачей, все чаще приводит в реанимации молодых. Что ждать от Лямбды (перуанец), пока не очень ясно, но эксперты настроены пессимистически.
Фото: Наталия Губернаторова
Вариант Лямбда C.37, названный перуанским, стремительно распространяется по миру. По данным ВОЗ, он выявлен уже в нескольких странах. В Перу, где Лямбду впервые обнаружили в августе, на него теперь приходится 82% новых случаев заражения. Для сравнения: в декабре здесь было выявлено всего 200 случаев Лямбды. В Чили он составляет уже треть всех заражений. Он также быстро распространяется в Аргентине, Бразилии, Колумбии, Эквадоре и Мексике.
И хотя пока вирусологи не видят никаких признаков того, что вариант Лямбда более агрессивен, но вирусологи уже называют его более заразным по сравнению с его предком из Уханя. По данным ВОЗ, пока нет достаточно надежных данных, чтобы сравнивать его с линиями Гамма или Дельта. Тем временем Альфа (B.1.1.7), Бета (B.1.351), Дельта (B.1.617.2) и Гамма (P.1) уже признаны ВОЗ «вариантами, вызывающими беспокойство». Они не только легче передаются, они еще и труднее поддаются лечению и могут привести к более серьезным последствиями для здоровья. «Вполне вероятно, что SARS-CoV-2 станет более трансмиссивным в ходе своей эволюции, но не обязательно более вредным для хозяина», — считает вирусолог Всемирной организации здравоохранения, доктор Мендес-Рико.
Все это наводит на тревожные мысли. Если изначально все ждали повторения пандемии испанки, в ходе которой вирус постепенно терял свою вирулентность (злобность), то сегодня становится все яснее, что с «короной» этого не происходит. И если год назад все надеялись на достижение коллективного иммунитета при достижении 70% популяции с антителами, то сегодня уже говорят о том, что пандемия коронавируса не закончится до тех пор, пока не будет вакцинировано не менее 80% населения мира. Варианты, подобные Лямбде, так и будут появляться до тех пор, пока это не будет достигнуто. И греческий алфавит их не остановит.
Особенно тревожит то, что Перу, где Лямбда заполонила собою все, один из самых высоких уровней смертности от коронавируса в мире: здесь пандемия унесла уже 187 тысяч жизней. Вирусологи предполагают, что страны Латинской Америки в скором времени станут главным котлом, где будут воспроизводиться новые линии и штаммы. Сегодня эксперты отмечают, что сочетание перегруженных систем здравоохранения, населения, работающего на нестабильной работе, не имеющего возможности соблюдать меры предосторожности, и отсутствия вакцин оказалось идеальной питательной средой для разновидности Лямбда.
И все же Лямбду обнаружили уже и во вполне благополучной Великобритании, а ее приход в Россию не за горами. Нельзя даже исключать, что он уже состоялся. Российский иммунолог Владислав Жемчугов назвал эту линию наиболее «злой» из всех выявленных мутаций SARS-CoV-2. По его словам, он более приспособлен, более устойчив, более заразен, более способен распространяться по миру. Поэтому он будет быстрее заражать тех, кто еще не переболел и не вакцинировался. Новaя конструкция дает этому коронaвирусу преимущество в размножении. Он начинает распространяться и вытеснять предыдущие.
Впрочем, и от Дельты у нас уже много проблем. Заведующий реанимацией ГКБ №52 Сергей Царенко заявил, что в последнее время ковид помолодел и протекает тяжелее. Врачи ковидариев отмечают, что в реанимации попадает все больше молодых людей, у которых никто не мог предположить тяжелого течения заболевания. Например, много спортсменов в возрасте до 30 лет. Некоторые медики осторожно предполагают, что агрессивное течение болезни могло спровоцировать употребление ими стероидных гормонов.
Есть версии, что коронавирус может достигнуть контагиозности кори и стать опасной детской болезнью. Как считает популяризатор науки Надежда Кудрявцева, нельзя исключать, что случаи детской заболеваемости будут все более тяжелыми: «То, что вирус будет поражать детей серьезно, — это, увы, возможно. Вирус кори, которую называют «детской чумой», происходит от вируса чумы крупного рогатого скота. Значит, первыми зараженными много столетий или тысячелетий назад, скорее всего, были взрослые, пастухи и доярки».
Вирусологи все менее охотно берутся делать прогнозы дальнейшего развития событий. Но уверены в одном: после ковида мир будет восстанавливаться, как после войны.
Иммунолог сравнил выявленные в России штаммы «Лямбда» и «Мю» с «Дельтой»
Штаммы коронавируса «Лямбда» и «Мю» вряд ли получат в России серьезное распространение, так как их комбинация свойств, в том числе заразность, значительно ниже, чем у доминирующего в стране варианта «Дельта». Такое мнение в понедельник, 1 ноября, выразил «Известиям» гендиректор компании «Клиникал Экселанс Груп», кандидат медицинских наук, иммунолог Николай Крючков.
«Была версия о том, что они хорошо адаптированы к поставкцинному иммунитету, к вакцинации, лучше адаптированы, кстати, лучше, чем «Дельта», видимо, но вот комбинация свойств, включая заразность, — их способность заражать, передаваться, — она все-таки ниже значительно, чем у «Дельты», — заявил он.
«Мю» и «Лямбда» по совокупности свойств, также значительно эволюционно проигрывают «Дельте», добавил эксперт.
«Поэтому я не думаю что они здесь получат сколько-нибудь серьезное распространение, а то, что они выявляются, понятное дело, что их там не два, не четыре случая на всю страну, их больше», — подчеркнул Крючков.
Случаев заражения вышеуказанными штаммами в России гораздо больше, уверен эксперт, однако их сложно выявить из-за недостаточно обширного секвенирования образцов.
Иммунолог напомнил, что источником линий «Мю» и «Лямбда» является Южная Америка, в частности перу и Колумбия. Однако, несмотря на то что там они получили неплохое распространение, во всем мире их случаев не так много по сравнению с другими вариантами.
В России же была распространена и линия «Гамма», и линия «Альфа» и даже «Бета», однако все поглотила «Дельта», отметил он.
Говоря о новом штамме AY.4.2, Крючков выразил уверенность, что для оценки его распространения в стране необходимо через 1,5–2 месяца провести широкую программу секвенирования. Иммунолог отметил, что скорость распространения данного штамма ниже, чем у «Дельты», и по свойствам он мало отличается от стандартных вариантов «Дельты».
«То есть максимум, что может быть заразность, там и 10% может не набраться, заразность будет выше, чем у стандартных представителей «Дельта»-линии. Других пока дополнительных каких-то свойств не выявлено, поэтому, конечно, с учетом того что он, даже если имеет какие-то эволюционные преимущества, это, скорее всего, связано с тем, что он неплохо адаптирован к поствакцинному иммунитету», — подчеркнул он.
В российской среде AY4.2 не факт, что получит такие же преимущества, как в британской, где высокий уровень вакцинации и ревакцинации, и будет так же распространяться, добавил Крючков.
Ранее в этот же день директор ЦНИИ эпидемиологии Роспотребнадзора Василий Акимкин сообщил, что в России выявили три случая штамма коронавируса «Мю» и один случай «Лямбды». Он подчеркнул, что при этом штамм «Дельта» остается доминирующим как в России, так и в мире.
Также в понедельник он рассказал, что на территории РФ в данный момент встречается до 10 сублиний «Дельта»-штамма коронавируса. По словам эксперта, «Дельта»-штамм в России имеет завозное происхождение и сейчас доминирует в стране, но его сублинии на данный момент пока не получили широкого распространения.
Кроме того, Акимкин отметил, что данных о том, что новый штамм коронавируса AY.4.2 вызывает более тяжелое течение заболевания или устойчив против антител, нет. По его словам, об этом свидетельствуют публикации органов здравоохранения Великобритании о результатах первичного анализа.
Руководитель группы геномики и постгеномных технологий ЦНИИ эпидемиологии Роспотребнадзора Анна Сперанская в понедельник сообщила «Известиям», что геновариант «Дельта»-штамма AY.4.2, активно захватывающий Великобританию и другие европейские страны, не распространяется в России. По ее словам, число загруженных в доступные базы геномов SARS-CoV-2 последовательностей этой сублинии не изменилось за те дни, когда впервые стало известно о ее обнаружении в РФ.
29 октября глава Роспотребнадзора Анна Попова заявила, что новый вариант «Дельта»-штамма COVID-19 AY.4.2 пока не отнесен к вариациям, которые требуют настороженного отношения. Также она пояснила, что появление данного варианта является обычной историей развития любого вируса.
На фоне ухудшения эпидемиологической ситуации российские власти призывают жителей вакцинироваться, чтобы обезопасить свое здоровье и позаботиться о своих близких. Граждан прививают бесплатно. В стране зарегистрировано пять вакцин от коронавируса: «Спутник V», ставший первой в РФ и мире вакциной от COVID-19, а также «Спутник Лайт», «ЭпиВакКорона», «ЭпиВакКорона-Н» и «КовиВак».
Вся актуальная информация по ситуации с коронавирусом доступна на сайтах стопкоронавирус.рф и доступвсем.рф, а также по хештегу #МыВместе. Телефон горячей линии по вопросам коронавируса: 8 (800) 2000-112.
Врачи назвали симптомы лямбда-штамма коронавируса
В Великобритании выявили случаи заражения лямбда-штаммом коронавируса. Об этом сообщает газета Express.
Изначально мутация была выявлена в Перу, Чили, Эквадоре и Аргентине, пишет «Газета.ру».
Лямбда-штамм содержит несколько мутаций в спайковом белке, из-за чего является более заразной версией COVID-19.
По словам врачей, рекомендуется обращать внимание на такие симптомы, как высокая температура, непрерывный кашель, а также потеря или изменение обоняния и вкуса: они могут свидетельствовать о наличии указанного штамма коронавируса.
Как отметил доктор медицинских наук, врач-иммунолог Владислав Жемчугов, лямбда-штамм, который идет путем размножения от человека к человеку, следует естественному для вируса состоянию — изменчивости. В геноме вирусов запрограммированы механизмы постоянного изменения, гены меняются друг с другом по всей длине генома, рассказал специалист.
«В зависимости от того, если новая конструкция дает выигрыш вирусу, то ее начинает вирус накапливать. А в чем выигрыш? Как раз в скорости размножения, преимуществ в новом пути передачи, то есть целью всего этого вирусного многоклеточного организма, так можно себе представить. Это значит, что накопиться и занять новую территорию», — объяснил Жемчугов в беседе с телеканалом «Звезда».
Ранее в июне ученые лондонского Института Фрэнсиса Крика выяснили, что белок, помогающий иммунитету бороться с вирусными инфекциями, мешает восстановлению легочных тканей. Речь шла об интерферонах I и III типа. В частности, интерферон (III типа) лямбда тестируют в американских лабораториях в качестве возможного компонента лечения от COVID-19.
В марте в индийском штате Махараштра была обнаружена индийская мутация коронавируса «Дельта». В минздраве Индии отмечали, что на тот момент было мало данных для установления связи между возникновением штаммов и ростом заболеваемости в ряде штатов. Впоследствии этот вариант коронавируса обнаружили в разных странах, в том числе в России. Новый штамм «Дельта плюс» отличается наличием мутации K417N в спайковом белке, которая может снижать активность сыворотки и антител переболевших и вакцинированных людей.
22 июня директор НИЦ эпидемиологии и микробиологии имени Гамалеи Александр Гинцбург заявил, что мутация индийского штамма коронавируса имеет особый характер взаимодействия с клетками. В частности, он не разрушает клетки, а распространяется, переходя из одной клетки в другую, образуя многоядерные клетки.
24 июня ученые сравнили штаммы «Дельта» и «Дельта плюс» и пришли к выводу, что это одна мутация коронавирусной инфекции, при этом «Дельта плюс» делает антитела менее эффективными.
27 июня официальный представитель Всемирной организации здравоохранения (ВОЗ) в России Мелита Вуйнович назвала ситуацию со штаммом коронавируса «Дельта плюс» тревожной, поскольку он набирает скорость распространения. Она отметила, что справиться с распространением «Дельты плюс» можно лишь путем выработки общего иммунитета и изменений в поведении.
Вся актуальная информация по ситуации с коронавирусом доступна на сайтах стопкоронавирус.рф и доступвсем.рф, а также по хештегу #МыВместе. Телефон горячей линии по вопросам коронавируса: 8-800-2000-112.