Лямбда штамм коронавируса что
Японские ученые описали уникальную мутацию штамма коронавируса «лямбда»
Штамм коронавируса Sars-CoV-2 «лямбда» обладает повышенной устойчивостью к иммунитету человека и более заразен. Об этом в препринте исследования сообщили несколько японских молекулярных биологов во главе с доцентом Токийского университета Кеем Сато, передает ресурс bioRxiv.
«Нам удалось показать, что мутации, характерные для этой вариации SARS-CoV-2, защищают вирус от действия антител и делают при этом его более заразным», — говорится в тексте.
Сейчас «лямбда»-штамм активно распространяется в Южной Америке. Откуда он появился – пока неизвестно, но возник он летом 2020 года. До начала распространения индийского штамма «дельта» именно «лямбда»-штамм был самым «популярным» в Перу, на него же приходилось до трети новых заражений в Чили и Аргентине.
В геноме штамма «лямбда», предположительно, присутствует сразу восемь мутаций. Он умеет столь же активно заражать клетки, как и индийский штамм, значительно превосходя британский, южноафриканский и китайский варианты коронавируса.
В ходе опытов исследователи из Японии выяснили, что повышенная заразность «лямбды» связана с изменением характера сцепления коронавируса с клеточным рецептором ACE2.
При этом для нейтрализации штамма требуется примерно в полтора раза больше антител, чем для других вариаций. Это связано с удалением существенной части генома коронавируса, изменением кодирования региона оболочки вируса, куда крепится S-белок, отвечающий за его проникновение в клетку тела.
В тексте указывается, что данная мутация уникальна – ранее она не встречалась ни у одного из описанных штаммов.
Как отмечает агентство ТАСС, препринт научной статьи пока не рецензировали, редакторы научных журналов ее тоже еще не проверяли.
Скоро в России
«Лямбда»-штамм рано или поздно начнет распространяться по России — границы с популярными среди туристов странами открыты, поэтому риски проникновения нового варианта коронавируса возрастают. Об этом «Газете.Ru» ранее сообщала врач-инфекционист Светлана Ищенко.
«Из-за туризма постоянно идет смена территории распространения вируса. Соответственно, он меняет свои патогенные свойства. Покидая территорию, он идет на другую территорию, где население еще не подготовлено», — сказала медик.
С ней согласен врач-инфекционист Евгений Тимаков. По его мнению, для сдерживания распространения нового штамма необходимо вводить ограничения на полеты в страны с высокой заболеваемостью.
«Насколько скоро «лямбда»-штамм придет в Россию, зависит от наших туристических потоков. Все, что есть в мире – будет и в России. Например, мы открыли Турцию – а там рост заболеваемости. Другие туристические страны тоже открыты. Как ситуация будет развиваться, неизвестно. Но, наверное, необходимо пересмотреть ограничительные меры», — сказал медик «Газете.Ru».
Данная мутация пока недостаточно изучена, подчеркнула заведующая лабораторией этиологии и эпидемиологии гриппа Федерального научно-исследовательского Центра эпидемиологии и микробиологии им. Гамалеи Елена Бурцева.
«Прогнозировать что-либо крайне рано: необходимо осуществлять непрерывный мониторинг проявлений вируса. Пока неизвестно, насколько он распространится в России, насколько будет защищать от него вакцина», — пояснила она «Газете.Ru».
Остановить распространение новой мутации поможет вакцинация. Хотя проявления нового штамма пока не изучены, антитела в любом случае помогут быстрее справиться с болезнью. «Сейчас как никогда нужно вакцинироваться и создавать иммунную прослойку. Вакцинация всегда останавливала эпидемии. И если в организме создаются защитные антитела, они на 100% не будут защищать организм, но при встрече с возбудителем болезнь будет протекать легче», — заключила Ищенко.
На Россию надвигается новый штамм: Лямбда обещает стать самой смертоносной
Чего ждать от новой волны пандемии коронавируса
Новая линия штаммов коронавируса, названная греческой буквой Лямбда, вызывает все больше беспокойства у мирового научного сообщества. И хотя Всемирная организация здравоохранения пока не внесла его в список штаммов, представляющих особую опасность, он уже попал в список штаммов, нуждающихся в пристальном наблюдении. До сих пор Лямбда гуляла по странам Латинской Америки, однако на днях первые инфицированные им обнаружены в Великобритании. А значит, не за горами то, что он появится и у нас. Что нам ждать от Лямбды, узнал «МК».
С момента появления в конце декабря 2019 года в Ухане новый коронавирус SARS-CoV-2 постоянно мутирует. «Среди вариантов, которые сегодня ВОЗ причисляет к сонму вызывающих беспокойство, — Альфа, Бета и Дельта. Их уже называют «коронавирусными тяжеловесами». По данным ряда ученых и популяционных наблюдений, Дельта сегодня занимает лидирующие позиции в Москве и Санкт-Петербурге, — рассказал «МК» молекулярный биолог Константин Семенов. — К вариантам, за которыми следует наблюдать, относят Каппу, Йоту и Лямбду. Исследователи следят за их распространенностью, поскольку они могут представлять глобальную угрозу. К счастью, пока не все мутации коронавируса нарушают эффективность иммунного ответа, вызванного вакцинацией, некоторые, например, делают вирус более контагиозным, то есть заразным. И все же поводы для беспокойства уже есть».
Ученые подозревают, что наиболее опасен как раз вариант Лямбда. Сегодня Лямбда успешно вытесняет Гамму (бывший бразильский штамм) в Латинской Америке. Лямбда распространяется преимущественно в странах Южной Америки, включая Чили, Перу, Аргентину и Эквадор. В пятницу первые шесть инфицированных им были выявлены на Туманном Альбионе. В целом же Лямбда присутствует уже более чем в 30 странах мира.
Как рассказывает Константин Семенов, линия Лямбда имеет 8 ключевых мутаций, что, вероятно, делает его устойчивым к нейтрализующим антителам, которые были получены после вакцинации или после естественной инфекции. Недавно ученые обнаружили, что одна из мутаций делает штамм очень высоко заразным, что объясняет его стремительное распространение по странам Латинской Америки. В опубликованной на днях научной работе за авторством молекулярного биолога и биотехнолога из Университета Мадраса (Индия), доктора Прийома Бозе отмечается, что Лямбда-вариант SARS-CoV-2 демонстрирует более высокую инфекционность и иммунную устойчивость. Например, в Чили около 60% населения получили хотя бы одну дозу вакцины от COVID-19. Но весной 2021 года здесь наблюдался стремительный всплеск случаев заболевания COVID-19. Это объясняется тем, что вариант Лямбда способен ускользать от иммунного ответа, вызванного вакцинацией, считают ученые. Важнейшими вирусологическими особенности варианта Лямбда доктор Бозе считает устойчивость к антителам (так, для нейтрализации вируса требуется в полтора раза больше антител, чем для нейтрализации его предшественника из Уханя) и увеличение скорости передачи вируса. Впрочем, есть и хорошие новости. Ученые выяснили, что только повышенная вирусная инфекционность — еще не свидетельство того, что вирус будет быстро и масштабно распространяться. Например, такое наблюдалось с вариантом Эпсилон, о котором почти никто не слышал. А все потому, что даже на фоне своей высокой способности к заражению он не смог распространиться в человеческой популяции. Поэтому ВОЗ признала его не представляющим опасности.
«Чтобы понять, заразит ли вариант большое количество людей, важно определить две его характерные особенности, а именно: повышенную вирусную инфекционность и способность к уклонению от иммунного ответа. Последние исследования показывают, что вариант Лямбда обладает обеими этими вирусологическими особенностями», — отмечает доктор Прийом Бозе.
«Лямбда-вариант распространяется в латиноамериканских странах. Он имеет высокую инфекционную способность, но больше всего беспокоит то, что он распространяется и в Чили, в которой вакцинировано около 60% населения, — рассказала «МК» микробиолог, ассистент кафедры науки педагогического факультета Manchester Metropolitan University Виктория Доронина. — Однако в Чили 93% всех вакцинированных вакцинировано китайской вакциной КоронаВак, остальные Пфайзером. Под 60% понимается первая доза, а после первой дозы эффективность КоронаВака составляет 3%. То есть люди расслабились после первой дозы, отбросили все ограничения. Эквивалентом КоронаВака в России является прививка, созданная институтом Чумакова. Насколько вариант Лямбда опасен для России? Высокоинфекционные варианты стали появляться в Латинской Америке уже год назад. Но из-за сокращения авиасообщений они не получили распространения в Европе, включая Россию. Для России гораздо большую опасность представляет вариант Дельта (индийский). И опыт Британии показывает, что вакцинация ДНК-вакциной значительно сокращает число заболевших и тяжесть течения заболевания. В России такая вакцина есть».
Однако многие российские ученые пока либо не готовы дать оценку опасности Лямбды, либо склоняются к оптимистическим сценариям. Один российский вирусолог, пожелавший остаться анонимным, в беседе с обозревателем «МК» отметил, что пока по Лямбде нет ни одной внушающей доверие работы в серьезном научном журнале: «Если что-то появится, тогда можно будет оценивать его перспективы. Но пока гораздо большую обеспокоенность вызывает Дельта».
Тем временем в научном центре «Вектор» Роспотребнадзора вероятность того, что Лямбда сможет вытеснить Дельту, назвали «сомнительной». По данным Роспотребнадзора, в России пока случаи Лямбды не выявлены.
Новый штамм коронавируса Лямбда напугал повышенной смертностью
Страны Латинской Америки стали новым «котлом» для COVID-19
Похоже, буквы греческого алфавита кончатся быстрее, чем новые выявляемые штаммы коронавируса. Не успели мы опомниться от нашествия Дельты, как в нескольких уголках земного шара уже появилась линия Лямбда. И если в начале пандемии все ждали, что со временем вирус будет становиться более заразным, при этом одновременно снижая свою агрессивность и способность к причинению тяжкого вреда, теперь эксперты оценивают ситуацию более скептически. Так, линия Дельта (индус), по наблюдениям врачей, все чаще приводит в реанимации молодых. Что ждать от Лямбды (перуанец), пока не очень ясно, но эксперты настроены пессимистически.
Фото: Наталия Губернаторова
Вариант Лямбда C.37, названный перуанским, стремительно распространяется по миру. По данным ВОЗ, он выявлен уже в нескольких странах. В Перу, где Лямбду впервые обнаружили в августе, на него теперь приходится 82% новых случаев заражения. Для сравнения: в декабре здесь было выявлено всего 200 случаев Лямбды. В Чили он составляет уже треть всех заражений. Он также быстро распространяется в Аргентине, Бразилии, Колумбии, Эквадоре и Мексике.
И хотя пока вирусологи не видят никаких признаков того, что вариант Лямбда более агрессивен, но вирусологи уже называют его более заразным по сравнению с его предком из Уханя. По данным ВОЗ, пока нет достаточно надежных данных, чтобы сравнивать его с линиями Гамма или Дельта. Тем временем Альфа (B.1.1.7), Бета (B.1.351), Дельта (B.1.617.2) и Гамма (P.1) уже признаны ВОЗ «вариантами, вызывающими беспокойство». Они не только легче передаются, они еще и труднее поддаются лечению и могут привести к более серьезным последствиями для здоровья. «Вполне вероятно, что SARS-CoV-2 станет более трансмиссивным в ходе своей эволюции, но не обязательно более вредным для хозяина», — считает вирусолог Всемирной организации здравоохранения, доктор Мендес-Рико.
Все это наводит на тревожные мысли. Если изначально все ждали повторения пандемии испанки, в ходе которой вирус постепенно терял свою вирулентность (злобность), то сегодня становится все яснее, что с «короной» этого не происходит. И если год назад все надеялись на достижение коллективного иммунитета при достижении 70% популяции с антителами, то сегодня уже говорят о том, что пандемия коронавируса не закончится до тех пор, пока не будет вакцинировано не менее 80% населения мира. Варианты, подобные Лямбде, так и будут появляться до тех пор, пока это не будет достигнуто. И греческий алфавит их не остановит.
Особенно тревожит то, что Перу, где Лямбда заполонила собою все, один из самых высоких уровней смертности от коронавируса в мире: здесь пандемия унесла уже 187 тысяч жизней. Вирусологи предполагают, что страны Латинской Америки в скором времени станут главным котлом, где будут воспроизводиться новые линии и штаммы. Сегодня эксперты отмечают, что сочетание перегруженных систем здравоохранения, населения, работающего на нестабильной работе, не имеющего возможности соблюдать меры предосторожности, и отсутствия вакцин оказалось идеальной питательной средой для разновидности Лямбда.
И все же Лямбду обнаружили уже и во вполне благополучной Великобритании, а ее приход в Россию не за горами. Нельзя даже исключать, что он уже состоялся. Российский иммунолог Владислав Жемчугов назвал эту линию наиболее «злой» из всех выявленных мутаций SARS-CoV-2. По его словам, он более приспособлен, более устойчив, более заразен, более способен распространяться по миру. Поэтому он будет быстрее заражать тех, кто еще не переболел и не вакцинировался. Новaя конструкция дает этому коронaвирусу преимущество в размножении. Он начинает распространяться и вытеснять предыдущие.
Впрочем, и от Дельты у нас уже много проблем. Заведующий реанимацией ГКБ №52 Сергей Царенко заявил, что в последнее время ковид помолодел и протекает тяжелее. Врачи ковидариев отмечают, что в реанимации попадает все больше молодых людей, у которых никто не мог предположить тяжелого течения заболевания. Например, много спортсменов в возрасте до 30 лет. Некоторые медики осторожно предполагают, что агрессивное течение болезни могло спровоцировать употребление ими стероидных гормонов.
Есть версии, что коронавирус может достигнуть контагиозности кори и стать опасной детской болезнью. Как считает популяризатор науки Надежда Кудрявцева, нельзя исключать, что случаи детской заболеваемости будут все более тяжелыми: «То, что вирус будет поражать детей серьезно, — это, увы, возможно. Вирус кори, которую называют «детской чумой», происходит от вируса чумы крупного рогатого скота. Значит, первыми зараженными много столетий или тысячелетий назад, скорее всего, были взрослые, пастухи и доярки».
Вирусологи все менее охотно берутся делать прогнозы дальнейшего развития событий. Но уверены в одном: после ковида мир будет восстанавливаться, как после войны.
В ритме штамма: что известно о «Лямбда»-варианте коронавируса
Высокопатогенный «Лямбда»-штамм коронавируса уже выявили в Аргентине, Чили, Австралии, Бразилии, Эквадоре, Германии, Испании, Великобритании и США. Впервые этот вариант SARS-CoV-2 обнаружили перуанские ученые в августе 2020 года. С тех пор он значительно распространился по Южной Америке. Ученые из этого региона пишут, что критическая ситуация в системе здравоохранения и рост смертности связаны с растущей распространенностью именно варианта «Лямбда». У этого штамма есть мутации в шипе коронавируса, которые обычно связывают с более эффективным проникновением в клетки и способностью «уходить» от антител.
Латиноамериканский мотив
В Россию недавно проникли штаммы коронавируса «Дельта» и «Дельта плюс», которые специалисты оценили как более патогенные: для заражения COVID-19 нужно меньшее количество вирусных частиц. Такие варианты могли появиться только в месте, где много зараженных, то есть вирус способен пройти эволюционный отбор на большом количестве болеющих людей. Такая ситуация наблюдается в Индии, которая сейчас на втором месте в мире по числу инфицированных.
Есть еще один огромный резервуар, где вирус может эффективно эволюционировать, — Бразилия (на третьем месте по количеству зараженных) и другие страны Латинской Америки: Аргентина (8-е место), Колумбия (10-е), Перу (18-е), Чили (22-е). В этом регионе возник штамм «Лямбда». ВОЗ присвоила такое название этому варианту коронавируса 15 июня. Организация обозначила этот штамм как Variants of Interest (VOI) — вызывающий интерес. Вскоре ВОЗ может переквалифицировать его в вызывающий беспокойство (Variant of Concern, VOC), считают специалисты диагностической лаборатории SARS-CoV-2 клинической больницы Порту-Алегри (Риу-Гранди-ду-Сул, Бразилия). Об этом ученые написали в научной статье «Первое выявление варианта SARS-CoV-2 Lambda (C.37) в южной части Бразилии».
Сейчас этот штамм обнаружен уже в 26 странах мира, в том числе в Аргентине, Чили, Австралии, Бразилии, Эквадоре, Германии, Испании, Великобритании и США. Это подтверждается и в статье перуанских ученых. Аргентинские ученые обращают внимание на абсолютную уникальность «Лямбды»: «Сочетание мутаций, характерных для вариантов «Бета» (южноафриканский штамм) и «Дельта» (индийский штамм), не обнаружено».
Бразильские генетики обратили внимание на новую мутацию S-белка в этом варианте: Δ246-252. Ее опасность пока не оценена. Перуанские ученые также выражают беспокойство по поводу этой мутации. Они написали, что другие мутации в белке-шипе коронавируса связаны с распространенными инфекциями у пациентов с подавленным иммунитетом.
— Пока не представляется возможным сказать, к каким именно изменениям приведет эта мутация, — сказал «Известиям» руководитель лаборатории геномной инженерии МФТИ Павел Волчков. — Но любая мутация в RBD-домене (рецептор-связывающий домен, который отвечает за соединение коронавируса с клеткой организма человека. — «Известия») обычно приводит к улучшению возможности проникновения в клетку и ускользания от антител. Но это еще требуется доказать с помощью дополнительных экспериментов.
Вооружен и очень опасен
Бразильские специалисты обратили внимание на способность «Лямбда»-штамма к более быстрому распространению и пониженной чувствительности к нейтрализации антителами. Это может значительно повлиять на эффективность стратегий борьбы с пандемией COVID-19, написали они.
Аргентинские специалисты описали ситуацию, когда у них на глазах андский вариант (как они называют «Лямбда»-коронавирус) начал побеждать британский.
«На данный момент из в общей сложности 2238 образцов, проанализированных посредством активного наблюдения с помощью секвенирования Spike или всего генома, наиболее обнаруженными вариантами были линия C.37 (андский вариант)», — сообщили ученые.
У штамма «Лямбда» множество мутаций, сказал «Известиям» профессор кафедры геномики и биоинформатики СФУ, профессор Геттингенского университета Константин Крутовский.
— Для нового варианта «Лямбда» характерна делеция в гене ORF1a — Δ3675-3677, приводящая к выпадению трех аминокислот. Этот ген кодирует несколько важных для вируса белков. Эта делеция присутствует также в «Альфа» (британский вариант), «Дельта» (южно-африканский) и «Гамма» (другой бразильский) штаммах с повышенной инфекционностью и классифицируемых ВОЗ как варианты, вызывающие озабоченность.
По словам Константина Крутовского, у штамма «Лямбда» есть новая делеция Δ246-252, приводящая к выпадению семи аминокислот, и множественные значимые мутации в гене шипа. Последние вызывают замены аминокислот в шиповидном белке, ответственном за связывание вируса с рецепторами на поверхности клеток человека. Это в дополнение к 19 другим мутациям, подчеркнул эксперт. Изменения L452Q и F490S находятся в самом важном районе шиповидного белка — рецептор-связывающем домене (RBD). Кроме того, было показано, что мутация F490S связана с пониженной чувствительностью к нейтрализации антител.
Но пока неизвестно, является ли вариант «Лямбда» более инфекционным или патогенным, чем другие штаммы, и способен ли он избегать действия доступных вакцин, отметил Константин Крутовский.
— «Лямбды» можно было бы опасаться, если бы не «Дельта». Их противоборство можно было бы увидеть, если есть страны, где представлен и тот, и другой вариант SARS-CoV-2. Судя по базе, эти штаммы встречаются в некоторых европейских странах. Но, если судить по тому, насколько быстро сейчас распространяется вариант «Дельта», он посильней, — высказал мнение Павел Волчков.
Все-таки лидером по производству новых штаммов остается Индия, хотя страны Южной Америки вполне могут с ней поконкурировать, заключил эксперт.
Всемирная организация здравоохранения (ВОЗ) выделила шестой штамм коронавируса SARS-CoV-2, назвав его «лямбда». Он особенно распространён в Южной Америке и впервые был идентифицирован в прошлом году в Перу.
Новый штамм коронавируса SARS-CoV-2
Согласно Euronews, «лямбда» была обнаружена как минимум в 27 странах. На данный момент специалисты ВОЗ отнесли лямбда-версию к «вызывающей интерес», а это значит, что пока нет повода для особенного беспокойства.
Данные, опубликованные Панамериканской организацией здравоохранения (ПАОЗ), показывают, что вариант лямбда был обнаружен в Перу в 82% лабораторных проб, зарегистрированных в мае и июне. Региональный советник ПАОЗ по новым вирусным заболеваниям Хайро Мендес заявил в конце июня, что штамм вируса был обнаружен в восьми странах Латинской Америки и Карибского бассейна, но «спорадически» присутствовал в большинстве стран региона.
Что говорят перуанские учёные о штамме лямбда
В Перу утверждают, что вариант лямбда (C.37) был впервые зарегистрирован в Лиме в декабре 2020 года, а с апреля этого года почти все коронавирусные инфекции в стране вызваны им. Вариант лямбда, или андский штамм, имеет критические мутации в спайковом (S) белке, пишет gestion.pe.
С увеличением заражений «лямбдой» другие штаммы SARS-CoV-2 со временем снижали своё присутствие. За последние четыре месяца вариант альфа составлял 0,5% заражений населения Перу, а вариант гамма — 1,2%.
Как поясняют авторы исследования, опубликованном в medRxiv:
«Распространение C.37 произошло в Южной Америке в присутствии сотен циркулирующих штаммов и альфа- и гамма-летучих органических соединений, что предполагает более высокую трансмиссивность этого штамма. Однако необходимы дополнительные эпидемиологические данные и анализ для оценки его передачи, вирулентности и свойств ускользания иммунитета».
Лямбда-вариант завоёвывает мир
В Чили и Аргентине наблюдается рост случаев COVID-19, связанных с лямбда-вариантом. По состоянию на апрель 2021 года этот штамм составлял 33% геномных последовательностей коронавируса в Чили и 12% геномных последовательностей коронавируса в Аргентине.
В Бразилии вариант лямбда был обнаружен в феврале прошлого года в Сан-Паулу. Специалисты Клинической больницы Порту-Алегри обнаружили восемь определяющих мутаций этого варианта в дополнение к 19 мутациям, уже описанным для других членов этой линии.
2 июля власти Великобритании сообщили, что подтверждено восемь случаев заражения «лямбдой», все в Англии. Эти пациенты часто выезжали за границу. По словам британцев, этот вариант имеет «потенциально повышенную трансмиссивность или возможную повышенную устойчивость к нейтрализующим антителам».
В испанском автономном сообществе Кантабрия недавно подтвердили три случая инфицирования лямбда-вариантом и изучают ещё 180 возможных эпизодов.
Более заразный
Вариант лямбда в упомянутом исследовании перуанцев проявил себя как более заразный вариант, чем альфа и гамма.
Исследователи использовали образцы плазмы от медицинских работников из Сантьяго, Чили, которые получили две дозы вакцины Sinovac COVID-19, чтобы сравнить эффективность вакцины против нового варианта по сравнению с тем, как она отреагировала на самые старые штаммы.
Они пришли к выводу, что мутации, присутствующие в спайковом белке варианта лямбда, значительно снижают эффективность вакцины по сравнению с вариантами альфа и гамма, хотя сравнения между вариантами лямбда и дельта не проводилось.
Симптомы «лямбда-ковида»
На данный момент выявленные симптомы варианта лямбда не отличаются от большинства других линий, вызывающих COVID-19. Среди них:
ВОЗ решила не обозначать разные штаммы COVID-19 названиями стран, где их обнаружили в первый раз. С этого момента учёные будут использовать буквы греческого алфавита…
В настоящий момент мир, в том числе и Россия, ведёт борьбу с вариантом дельта, который, по мнению специалистов ВОЗ, будет доминировать до августа.
Вариант дельта — самый заразный из обнаруженных до сих пор штаммов, с большей «способностью» цепляться и проникать в клетки, что определяет больший потенциал для возникновения эпидемий. Специалисты отмечают, что для обеспечения глобального иммунитета необходимо вакцинировать 70% населения.
Читайте по теме:
Добавьте «Правду.Ру» в свои источники в Яндекс.Новости или News.Google, либо Яндекс.Дзен
Быстрые новости в Telegram-канале Правды.Ру. Не забудьте подписаться, чтоб быть в курсе событий.